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手足癣大多是真菌中的癣菌所引起，主要有红色毛癣菌、絮状表皮癣菌、石膏样毛癣菌、玫瑰色毛癣菌及白色念珠菌等。以上这些真菌，除了引起不同类型的足癣外，也可侵犯皮肤的其他部位。引起不同部位的癣病。
       足部感染了真菌，并不一定都会得足癣。而且，足癣并非纯属真菌病。近年来，美国的皮肤病专家把足癣分为单纯性足癣和复杂性足癣。单纯性足癣，是指纯粹由真菌引起;复杂性足癣，为多种病菌所造成。因为单纯性足癣，症状较轻，在鳞屑中只能查到真菌，而复杂性足癣，症状比较严重，在皮损内可培养出多种细菌，如细球菌、皮表短颈菌和假单孢菌属、变形杆菌属及其他细菌。由于多种细菌能联合抑制真菌生长，因此在皮损内却查不到真菌。专家认为，重型足癣的发生。并不是多种细菌直接入侵，而是真菌打头阵，先行侵入皮肤后，多种细菌才趋视而人，一旦多种细菌站住脚后，即把真菌“镇压”下去取而代之。
       外观正常的足部，有时也能查到或培养出真菌。因为感染了数量不多的真菌形不成力量，还不至于造成危害。而且正常的足部皮肤既可以抵抗病菌的侵害，较厚的角质层还有屏障作用，所以，感染了真菌并不一定会有足癣的表现。